課程名稱 |
系統生物學 SYSTEMS BIOLOGY |
開課學期 |
99-1 |
授課對象 |
生命科學院 生命科學系 |
授課教師 |
阮雪芬 |
課號 |
MCB5028 |
課程識別碼 |
B43 U1440 |
班次 |
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學分 |
3 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期四5,6(12:20~14:10)星期五5(12:20~13:10) |
上課地點 |
生科4A生科4A |
備註 |
限學士班三年級以上 總人數上限:70人 |
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/991sysbio |
課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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課程概述 |
系統生物學是在生物學上一個新興的領域,它著重於以系統的觀點來了解生物系統的運作。由於基因體、蛋白質體、代謝體及生物資訊技術的發展,使得系統生物學的研究愈發可行了,對於生物轉變進行整體研究將能加快闡明生化路徑及疾病治療的速度。除此之外,系統生物學也著重於描述和了解複雜的生物系統如何運作以及發展預測人類疾病的模式。本課程將探討系統生物學的基礎學理知識,並以藥物及能源開發為實例,使學員了解系統生物學能在研究領域的運用。 |
課程目標 |
本課程將使學員對於系統生物學的學理與應用能有所了解。 |
課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
1. Systems Biology: Concepts, Implementation and Application
作者:Edda Klipp, Ralf HerwigWolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald, Hans Lehrach, and Ralf Herwig (2008)
2. A Primer of Genome Science (2009) 3nd.
作者:G. Gibson and S. V. Muse, Sinauer Associates, Inc
3. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits
作者:Uri Alon
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評量方式 (僅供參考) |
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
1. |
平時表現 |
15% |
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2. |
期中考 |
35% |
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3. |
作業 |
50% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
9/16,9/17 |
系統生物學簡介 Brief introduction to systems biology (阮) |
第2週 |
9/23,9/24 |
高通量技術:基因體學High-throughput techniques: genomics (阮) |
第3週 |
9/30,10/01 |
高通量技術:轉錄體學High-throughput techniques: transcriptomics (阮) |
第4週 |
10/07,10/08 |
高通量技術:蛋白質體學 High-throughput techniques: proteomics (阮) |
第5週 |
10/14,10/15 |
數學基礎:線性代數 Mathematics overview: Algebra (項) |
第6週 |
10/21,10/22 |
高通量技術:代謝體學High-throughput techniques: proteomics & Metabolomics (阮) |
第7週 |
10/28,10/29 |
數學基礎:微分方程 Mathematics overview: Differential equation (項) |
第8週 |
11/04,11/05 |
高通量資料分析 High-throughput data analysis (阮) |
第9週 |
11/11,11/12 |
期中考Mid-exam |
第10週 |
11/18,11/19 |
生物系統模型 Modeling of biological systems (黃) |
第11週 |
11/25,11/26 |
生物網路簡介Biological networks (黃) |
第12週 |
12/02,12/03 |
生物網路模組Network motif I (黃) |
第13週 |
12/09,12/10 |
生物網路模組Network motif II (黃) |
第14週 |
12/16,12/17 |
生物網路模組Network motif III (黃) |
第15週 |
12/23,12/24 |
Robustness I (黃) |
第16週 |
12/30,12/31 |
Robustness II (黃) |
第17週 |
1/06,1/07 |
Optimality and Evolution (黃) |
第18週 |
1/13, 1/14 |
期末考週 |
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